Il est emmené à Gaza, où il reste détenu plus de cinq ans sans accès du CICR. Sa capture devient un enjeu central des opérations militaires et des négociations de prisonniers. Sa libération intervient dans un échange en octobre 2011.
Des combattants palestiniens capturent Gilad Shalit
Le 25 juin 2006, des combattants palestiniens venus de Gaza attaquent un poste militaire et un char près de Kerem Shalom et capturent le soldat israélien Gilad Shalit.